文献速递 | 转录组在慢性炎症研究中的应用
转录调控是指通过调理基因转录水平来控制基因表达的历程。。。。它是细胞内基因表达调控的主要机制之一，，，，，，可以通过激活或抑制转录因子与DNA连系来影响基因的转录历程。。。。慢性炎症是一种一连保存的炎症反应，，，，，，与多种疾病的爆发和生长亲近相关。。。。炎症反应的调控主要涉及到多种信号通路和分子机制，，，，，，其中包括转录调控。。。。它能通过调理基因的转录水平来影响炎症反应的爆发和生长。。。。进一步的研究其在慢性炎症中的机制，，，，，，有助于深入明确炎症相关疾病的发病机制，，，，，，并为开发新的治疗战略提供理论依据。。。。
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1 .NRF2活化可重新编程氧化代谢缺陷，，，，，，以恢复慢性壅闭性肺疾病的巨噬细胞功效
文章问题：NRF2 Activation Reprograms Defects in Oxidative Metabolism to Restore Macrophage Function in Chronic Obstructive Pulmonary Disease
揭晓期刊：American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine
影响因子：24.7
中科院分区：1区
揭晓时间：2023.4
摘要
慢性壅闭性肺疾病(COPD)是以一连气道炎症和巨噬细胞功效杂乱为特征的疾病。。。。巨噬细胞生物能量学改变导致抗氧化反应受损和疾病发病的水平尚不清晰。。。。本研究对慢性壅闭性肺疾病(COPD)供者和康健供者的AMs和MDMs举行了功效、代谢和转录组剖析。。。。研究发明来自慢性壅闭性肺病供体的AMs和MDMs显示出糖酵解和线粒体呼吸衍生能量储备的严重耗竭，，，，，，由于太过依赖糖酵解导致能量状态降低。。。。别的，，，，，，与NADPH天生酶ME1（苹果酸酶1）表达缺陷相关的氧化还原平衡受损，，，，，，然而，，，，，，选择性激活NRF2可重置COPD转录组，，，，，，从而增添TCA循环中心产品的天生、改善能量状态、有利的氧化还原平衡以及巨噬细胞功效的恢复。。。。
2 .神经元-少突胶质细胞钾穿梭在Ranvier的节点处可避免炎症性脱髓鞘
文章问题：Neuron-oligodendrocyte potassium shuttling at nodes of Ranvier protects against inflammatory demyelination
揭晓期刊：Journal of Clinical Investigation
影响因子：15.9
中科院分区：1区
揭晓时间：2023.4
摘要
多发性硬化症（MS）是一种中枢神经系统举行性炎症性脱髓鞘疾病。。。。越来越多的证据批注，，，，，，多发性硬化症中的懦弱神经元随着时间的推移会体现出致命的代谢衰竭，，，，，，这种征象被假设是由慢性太过兴奋引起的。。。。轴突Kv7（向外整复）和少突胶质细胞Kir4.1钾通道在调理Ranvier结及其周围神经元的兴奋性方面起着主要作用。。。。本实验研究了神经元Kv7和少突胶质细胞Kir4.1通道之间的空间和功效关系，，，，，，并评估了皮质和视网膜投射神经元在心理性和炎症性脱髓鞘条件下的转录和功效特征。。。。发明这两种通道在多发性硬化症和实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）中都泛起了失调，，，，，，其中Kir4.1通道恒久下调，，，，，，而Kv7通道亚基在炎症性脱髓鞘历程中短暂上调。。。。别的还视察到，，，，，，用retigabine开通Kv7通道可降低人和EAE神经元的太过兴奋性，，，，，，改善EAE临床症状，，，，，，并拯救少突胶质细胞-Kir4.1缺陷（OL-Kir4.1缺陷）小鼠的神经元病理学。。。。研究效果批注，，，，，，神经元-少突胶质细胞的代偿相互作用通过Kv7和Kir4.1通道增进了恢复能力，，，，，，并确定了药理激活结节Kv7通道作为抗炎性脱髓鞘的神经保；ふ铰。。。。
3 .lncRNA LUCAT1在炎症性疾病中升高，，，，，，并通过调理NR4A2的剪接和稳固性来抑制炎症
文章问题：The lncRNA LUCAT1 is elevated in inflammatory disease and restrains inflammation by regulating the splicing and stability of NR4A2
揭晓期刊：Proceedings of the national academy of sciences of the united states of America
影响因子：11.1
中科院分区：1区
揭晓时间：2023.1
摘要
核长非编码RNA LUCAT1是人类髓系细胞中I型滋扰素和炎性细胞因子表达的负反响调理因子。。。。本项研究中，，，，，，我们明确了LUCAT1抑制炎症基因表达的机理基础。。。。通过质谱法和RNA免疫沉淀法对RNA连系卵白举行周全判断，，，，，，我们发明在mRNA的加工和替换剪接中起主要作用的卵白是LUCAT1连系卵白。。。。这些卵白包括异质核糖核卵白C、M和A2B1。。。。与之相一致的是，，，，，，缺乏LUCAT1的细胞改变了特定免疫基因的剪接。。。。特殊是，，，，，，在脂多糖刺激下，，，，，，核受体4A2（NR4A2）基因的剪接尤其受到影响。。。。因此，，，，，，在缺乏LUCAT1的细胞中，，，，，，NR4A2的表达镌汰并延迟。。。。NR4A2缺陷细胞的免疫基因表达升高。。。。这些视察效果批注，，，，，，LUCAT1被诱导控制NR4A2的剪接和稳固性，，，，，，而这正是LUCAT1抗炎作用的部分缘故原由。。。。别的，，，，，，研究还剖析了大宗的炎症性肠病患者以及哮喘和慢性壅闭性肺疾病患者。。。。在这些患者中，，，，，，LUCAT 1水平升高，，，，，，在这两种疾病中，，，，，，与疾病严重水平呈正相关。。。。这些研究通过mRNAs转录后调控确定了LUCAT 1依赖免疫调理的要害分子机制，，，，，，强调了其在炎症性疾病调控中的作用。。。。
参考文献
Ryan EM, Sadiku P, Coelho P, Watts ER, Zhang A, Howden AJM, Sanchez-Garcia MA, Bewley M, Cole J, McHugh BJ, Vermaelen W, Ghesquiere B, Carmeliet P, Rodriguez Blanco G, Von Kriegsheim A, Sanchez Y, Rumsey W, Callahan JF, Cooper G, Parkinson N, Baillie K, Cantrell DA, McCafferty J, Choudhury G, Singh D, Dockrell DH, Whyte MKB, Walmsley SR. NRF2 Activation Reprograms Defects in Oxidative Metabolism to Restore Macrophage Function in Chronic Obstructive Pulmonary Disease. Am J Respir Crit Care Med. 2023 Apr 15;207(8):998-1011. doi: 10.1164/rccm.202203-0482OC. PMID: 36724365; PMCID: PMC7614437.Kapell H, Fazio L, Dyckow J, Schwarz S, Cruz-Herranz A, Mayer C, Campos J, D'Este E, Möbius W, Cordano C, Pröbstel AK, Gharagozloo M, Zulji A, Narayanan Naik V, Delank A, Cerina M, Müntefering T, Lerma-Martin C, Sonner JK, Sin JH, Disse P, Rychlik N, Sabeur K, Chavali M, Srivastava R, Heidenreich M, Fitzgerald KC, Seebohm G, Stadelmann C, Hemmer B, Platten M, Jentsch TJ, Engelhardt M, Budde T, Nave KA, Calabresi PA, Friese MA, Green AJ, Acuna C, Rowitch DH, Meuth SG, Schirmer L. Neuron-oligodendrocyte potassium shuttling at nodes of Ranvier protects against inflammatory demyelination. J Clin Invest. 2023 Apr 3;133(7):e164223. doi: 10.1172/JCI164223. PMID: 36719741; PMCID: PMC10065072.
Vierbuchen T, Agarwal S, Johnson JL, Galia L, Lei X, Stein K, Olagnier D, Gaede KI, Herzmann C, Holm CK, Heine H, Pai A, O'Hara Hall A, Hoebe K, Fitzgerald KA. The lncRNA LUCAT1 is elevated in inflammatory disease and restrains inflammation by regulating the splicing and stability of NR4A2. Proc Natl Acad Sci U S A. 2023 Jan 3;120(1):e2213715120. doi: 10.1073/pnas.2213715120. Epub 2022 Dec 28. PMID: 36577072; PMCID: PMC9910463.
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