CRISPR/Cas9 gRNA 文库
CRlSPR/Cas9通过gRNA指导Cas9核酸酶对靶标基因举行 DNA修饰,,,以此造成基因的功效突变或缺失。。使用 CRlSPR/Cas9 手艺建设哺乳动物全基因组突变库或者与某类功效相关的基因突变体库,,,通过功效性筛选和富集以及随后的PCR扩增和深度测序剖析,,,掘客与筛选表型相关的基因,,,称为CRlSPR/Cas9 gRNA文库筛选。。gRNA文库是药物筛选或靶向筛选特定通路的理想工具,,,gRNA文库的建设将在功效基因筛选、疾病机制研究及药物研发等方面施展主要的功效。。
sgRNA文库包括敲除任一人类或小鼠基因的特异性sgRNA序列。。每个种属特异性文库分为两个子文库(A和B)。。当A和B一起使用,,,每个基因含有6条sgRNAs(每个文库含有3条)。。我们推荐尽可能使用完整库筛选,,,可是若是无法获得完整库的情形下,,,也可以使用子库举行筛选。。由于文库里构建的sgRNA数目增添,,,筛选历程中需要的细胞量也会更多,,,因此这种筛选的设计具有无邪性,,,可以更小规模的A文库(每个基因3条sgRNAs)或者用整个文库(每个基因6条sgRNAs)举行筛选。。
常用单载体文库骨架示意图:
CRlSPR/Cas9 gRNA 文库筛选流程:
CRlSPR/Cas9 gRNA 文库筛选概略流程分为五步,,,即 gRNA 文库选择、gRNA 文库扩增、gRNA 文库慢病毒包装、gRNA 文库筛选、PCR 扩增和 NGS 测序。。
1、 gRNA 文库选择
首先选择所需 gRNA 文库。。包括全基因组库和定制文库,,,接纳单/双慢病毒载体,,,这两种模式载体均携带有特另外抗性筛选标记。。
2、gRNA 文库扩增
gRNA 载体构建完成后混淆成一个 pool(即载体混淆库),,,随后将载体混淆库举行扩着述育,,,最后抽提质粒,,,即获得了扩增后的载体混淆库,,,也就是文库。。
3、gRNA 文库慢病毒包装
扩增后的 gRNA 文库举行慢病毒的包装,,,获得混淆型慢病毒库,,,每个慢病毒载体携带单个 gRNA。。
4、gRNA 文库筛选
对筛选的目的细胞举行病毒熏染预实验。。慢病毒库以较低的 MOI 值熏染细胞(确保每个细胞最多进入一个慢病毒),,,随后凭证实验目的而对细胞接纳响应的处置惩罚,,,最后经由差别的筛选方法富集细胞。。
5、PCR 扩增和 NGS 测序
对富集下来的细胞举行PCR 扩增,,,该扩增片断包括载体所携带的 gRNA 序列,,,通事后续的 NGS 测序,,,我们可以获得富集细胞中 gRNA 的富集度,,,从而寻找到响应的基因,,,这些基因很有可能加入药物作用历程,,,因此可作为深入研究的待选基因。。
UG环球生物文库信息: